Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AFDNP55196 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AFDNP55196 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AFDNP55196 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AFDNP55196 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AFDNP55196 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AFDNP55196 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AFDNP55196 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AFDNP55196 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AFDNP55196 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFDNP55196 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFDNP55196 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFDNP55196 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFDNP55196 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFDNP55196 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFDNP55196 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFDNP55196 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFDNP55196 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFDNP55196 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFDNP55196 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFDNP55196 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFDNP55196 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFDNP55196 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFDNP55196 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AFDNP55196 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AFDNP55196 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AFDNP55196 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AFDNP55196 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AFDNP55196 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AFDNP55196 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AFDNP55196 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AFDNP55196 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
AFDNP55196 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFDNP55196 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFDNP55196 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFDNP55196 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFDNP55196 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
AFDNP55196 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFDNP55196 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFDNP55196 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFDNP55196 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFDNP55196 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFDNP55196 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFDNP55196 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFDNP55196 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFDNP55196 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFDNP55196 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFDNP55196 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFDNP55196 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFDNP55196 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFDNP55196 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AFDNP55196 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AFDNP55196 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AFDNP55196 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AFDNP55196 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AFDNP55196 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AFDNP55196 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AFDNP55196 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
AFDNP55196 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
AFDNP55196 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AFDNP55196 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AFDNP55196 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AFDNP55196 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AFDNP55196 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFDNP55196 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFDNP55196 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFDNP55196 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFDNP55196 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFDNP55196 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFDNP55196 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
AFDNP55196 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFDNP55196 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFDNP55196 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFDNP55196 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFDNP55196 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFDNP55196 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
AFDNP55196 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFDNP55196 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFDNP55196 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFDNP55196 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFDNP55196 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFDNP55196 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFDNP55196 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
AFDNP55196 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFDNP55196 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFDNP55196 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFDNP55196 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFDNP55196 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFDNP55196 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFDNP55196 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFDNP55196 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFDNP55196 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFDNP55196 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFDNP55196 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFDNP55196 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFDNP55196 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AFDNP55196 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AFDNP55196 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AFDNP55196 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AFDNP55196 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms