Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RAD23BP54727 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD23BP54727 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms