Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFIP1P53367 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms