Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC3P51654 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC3P51654 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC3P51654 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC3P51654 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC3P51654 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC3P51654 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC3P51654 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC3P51654 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC3P51654 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC3P51654 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC3P51654 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC3P51654 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GPC3P51654 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC3P51654 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC3P51654 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC3P51654 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC3P51654 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC3P51654 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC3P51654 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC3P51654 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC3P51654 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC3P51654 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC3P51654 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC3P51654 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC3P51654 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC3P51654 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC3P51654 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC3P51654 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC3P51654 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC3P51654 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC3P51654 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC3P51654 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC3P51654 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC3P51654 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC3P51654 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC3P51654 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC3P51654 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC3P51654 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC3P51654 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC3P51654 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC3P51654 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC3P51654 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC3P51654 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC3P51654 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC3P51654 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC3P51654 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC3P51654 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC3P51654 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC3P51654 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC3P51654 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC3P51654 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC3P51654 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC3P51654 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC3P51654 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC3P51654 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC3P51654 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC3P51654 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC3P51654 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC3P51654 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC3P51654 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC3P51654 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC3P51654 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC3P51654 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC3P51654 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC3P51654 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC3P51654 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC3P51654 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC3P51654 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC3P51654 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC3P51654 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC3P51654 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC3P51654 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC3P51654 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC3P51654 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC3P51654 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC3P51654 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC3P51654 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC3P51654 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC3P51654 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC3P51654 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC3P51654 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC3P51654 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC3P51654 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC3P51654 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC3P51654 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC3P51654 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC3P51654 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC3P51654 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC3P51654 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC3P51654 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC3P51654 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC3P51654 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC3P51654 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC3P51654 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC3P51654 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC3P51654 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC3P51654 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC3P51654 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC3P51654 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms