Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TTPAP49638 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTPAP49638 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTPAP49638 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTPAP49638 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTPAP49638 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTPAP49638 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTPAP49638 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTPAP49638 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTPAP49638 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTPAP49638 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTPAP49638 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTPAP49638 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTPAP49638 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTPAP49638 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTPAP49638 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTPAP49638 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTPAP49638 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTPAP49638 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTPAP49638 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TTPAP49638 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TTPAP49638 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTPAP49638 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTPAP49638 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTPAP49638 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTPAP49638 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTPAP49638 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTPAP49638 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTPAP49638 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTPAP49638 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTPAP49638 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTPAP49638 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTPAP49638 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTPAP49638 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTPAP49638 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTPAP49638 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTPAP49638 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTPAP49638 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTPAP49638 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTPAP49638 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTPAP49638 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTPAP49638 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTPAP49638 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTPAP49638 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTPAP49638 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTPAP49638 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTPAP49638 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTPAP49638 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTPAP49638 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTPAP49638 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TTPAP49638 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTPAP49638 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TTPAP49638 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTPAP49638 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTPAP49638 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTPAP49638 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTPAP49638 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTPAP49638 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTPAP49638 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTPAP49638 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTPAP49638 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTPAP49638 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTPAP49638 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTPAP49638 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTPAP49638 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTPAP49638 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTPAP49638 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTPAP49638 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTPAP49638 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTPAP49638 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTPAP49638 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTPAP49638 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTPAP49638 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTPAP49638 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTPAP49638 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTPAP49638 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTPAP49638 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTPAP49638 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTPAP49638 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTPAP49638 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTPAP49638 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTPAP49638 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTPAP49638 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTPAP49638 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTPAP49638 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTPAP49638 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TTPAP49638 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TTPAP49638 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TTPAP49638 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TTPAP49638 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TTPAP49638 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TTPAP49638 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TTPAP49638 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTPAP49638 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTPAP49638 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTPAP49638 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTPAP49638 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTPAP49638 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTPAP49638 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTPAP49638 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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