Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNNI2P48788 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI2P48788 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms