Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PITPNBP48739 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PITPNBP48739 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms