Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRIP1P48552 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRIP1P48552 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms