Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRB2P47870 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.33■■□□□ 1
GABRB2P47870 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GABRB2P47870 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.33■■□□□ 1
GABRB2P47870 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GABRB2P47870 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRB2P47870 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRB2P47870 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRB2P47870 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRB2P47870 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRB2P47870 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRB2P47870 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRB2P47870 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRB2P47870 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRB2P47870 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRB2P47870 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRB2P47870 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GABRB2P47870 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GABRB2P47870 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRB2P47870 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRB2P47870 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRB2P47870 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRB2P47870 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRB2P47870 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRB2P47870 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRB2P47870 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRB2P47870 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRB2P47870 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRB2P47870 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRB2P47870 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRB2P47870 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRB2P47870 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GABRB2P47870 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRB2P47870 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRB2P47870 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRB2P47870 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRB2P47870 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRB2P47870 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRB2P47870 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRB2P47870 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRB2P47870 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GABRB2P47870 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRB2P47870 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRB2P47870 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRB2P47870 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRB2P47870 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GABRB2P47870 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms