Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA2P47869 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA2P47869 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA2P47869 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA2P47869 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA2P47869 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA2P47869 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA2P47869 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA2P47869 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA2P47869 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA2P47869 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA2P47869 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA2P47869 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA2P47869 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABRA2P47869 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms