Protein–RNA interactions for Protein: P47211

GALR1, Galanin receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALR1P47211 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GALR1P47211 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GALR1P47211 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GALR1P47211 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GALR1P47211 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GALR1P47211 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GALR1P47211 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GALR1P47211 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GALR1P47211 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GALR1P47211 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GALR1P47211 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GALR1P47211 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GALR1P47211 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GALR1P47211 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GALR1P47211 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALR1P47211 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALR1P47211 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALR1P47211 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALR1P47211 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALR1P47211 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALR1P47211 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALR1P47211 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GALR1P47211 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALR1P47211 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALR1P47211 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GALR1P47211 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALR1P47211 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALR1P47211 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALR1P47211 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALR1P47211 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALR1P47211 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALR1P47211 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALR1P47211 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALR1P47211 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALR1P47211 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALR1P47211 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALR1P47211 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALR1P47211 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALR1P47211 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALR1P47211 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALR1P47211 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALR1P47211 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GALR1P47211 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALR1P47211 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALR1P47211 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALR1P47211 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALR1P47211 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALR1P47211 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALR1P47211 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALR1P47211 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALR1P47211 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALR1P47211 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALR1P47211 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALR1P47211 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALR1P47211 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALR1P47211 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GALR1P47211 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALR1P47211 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALR1P47211 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALR1P47211 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GALR1P47211 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALR1P47211 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALR1P47211 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALR1P47211 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALR1P47211 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALR1P47211 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALR1P47211 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALR1P47211 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALR1P47211 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALR1P47211 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALR1P47211 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALR1P47211 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALR1P47211 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALR1P47211 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALR1P47211 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GALR1P47211 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALR1P47211 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALR1P47211 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALR1P47211 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALR1P47211 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALR1P47211 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALR1P47211 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALR1P47211 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GALR1P47211 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALR1P47211 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALR1P47211 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALR1P47211 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALR1P47211 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALR1P47211 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALR1P47211 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALR1P47211 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALR1P47211 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALR1P47211 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALR1P47211 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALR1P47211 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALR1P47211 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GALR1P47211 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALR1P47211 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALR1P47211 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GALR1P47211 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms