Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNNT3P45378 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TNNT3P45378 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TNNT3P45378 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TNNT3P45378 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TNNT3P45378 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNT3P45378 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNT3P45378 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNT3P45378 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNT3P45378 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNT3P45378 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNT3P45378 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNT3P45378 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNT3P45378 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNT3P45378 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNT3P45378 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNT3P45378 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNNT3P45378 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms