Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP62P37198 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP62P37198 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP62P37198 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP62P37198 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP62P37198 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP62P37198 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP62P37198 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP62P37198 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP62P37198 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP62P37198 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP62P37198 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP62P37198 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP62P37198 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP62P37198 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP62P37198 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP62P37198 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP62P37198 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP62P37198 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP62P37198 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP62P37198 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP62P37198 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP62P37198 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP62P37198 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP62P37198 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP62P37198 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP62P37198 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP62P37198 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP62P37198 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP62P37198 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP62P37198 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP62P37198 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP62P37198 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP62P37198 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP62P37198 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP62P37198 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP62P37198 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP62P37198 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP62P37198 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP62P37198 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP62P37198 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP62P37198 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP62P37198 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP62P37198 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP62P37198 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP62P37198 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP62P37198 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP62P37198 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP62P37198 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP62P37198 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP62P37198 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP62P37198 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP62P37198 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP62P37198 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP62P37198 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP62P37198 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP62P37198 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP62P37198 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP62P37198 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP62P37198 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP62P37198 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP62P37198 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP62P37198 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP62P37198 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP62P37198 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP62P37198 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP62P37198 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP62P37198 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP62P37198 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP62P37198 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP62P37198 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP62P37198 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP62P37198 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP62P37198 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP62P37198 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP62P37198 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP62P37198 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP62P37198 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP62P37198 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP62P37198 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP62P37198 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP62P37198 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP62P37198 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP62P37198 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP62P37198 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP62P37198 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP62P37198 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP62P37198 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP62P37198 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP62P37198 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP62P37198 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP62P37198 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP62P37198 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP62P37198 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP62P37198 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NUP62P37198 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NUP62P37198 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NUP62P37198 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NUP62P37198 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NUP62P37198 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms