Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJC1P36383 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJC1P36383 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJC1P36383 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJC1P36383 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJC1P36383 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJC1P36383 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJC1P36383 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJC1P36383 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJC1P36383 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJC1P36383 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJC1P36383 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJC1P36383 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJC1P36383 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJC1P36383 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJC1P36383 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJC1P36383 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJC1P36383 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GJC1P36383 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJC1P36383 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJC1P36383 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJC1P36383 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJC1P36383 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJC1P36383 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJC1P36383 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJC1P36383 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJC1P36383 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJC1P36383 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJC1P36383 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJC1P36383 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJC1P36383 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJC1P36383 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJC1P36383 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJC1P36383 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJC1P36383 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GJC1P36383 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJC1P36383 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJC1P36383 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJC1P36383 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJC1P36383 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJC1P36383 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJC1P36383 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJC1P36383 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJC1P36383 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GJC1P36383 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJC1P36383 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJC1P36383 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJC1P36383 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJC1P36383 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJC1P36383 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJC1P36383 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJC1P36383 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJC1P36383 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJC1P36383 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJC1P36383 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJC1P36383 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJC1P36383 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJC1P36383 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJC1P36383 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJC1P36383 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJC1P36383 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJC1P36383 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJC1P36383 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJC1P36383 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJC1P36383 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJC1P36383 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJC1P36383 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJC1P36383 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJC1P36383 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJC1P36383 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJC1P36383 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJC1P36383 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJC1P36383 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJC1P36383 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJC1P36383 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJC1P36383 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJC1P36383 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJC1P36383 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJC1P36383 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJC1P36383 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJC1P36383 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJC1P36383 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJC1P36383 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJC1P36383 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJC1P36383 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJC1P36383 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJC1P36383 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GJC1P36383 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GJC1P36383 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJC1P36383 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJC1P36383 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJC1P36383 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJC1P36383 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJC1P36383 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJC1P36383 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJC1P36383 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJC1P36383 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJC1P36383 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJC1P36383 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJC1P36383 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms