Protein–RNA interactions for Protein: P34932

HSPA4, Heat shock 70 kDa protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4P34932 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HSPA4P34932 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSPA4P34932 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSPA4P34932 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSPA4P34932 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSPA4P34932 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSPA4P34932 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSPA4P34932 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSPA4P34932 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HSPA4P34932 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSPA4P34932 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSPA4P34932 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSPA4P34932 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSPA4P34932 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSPA4P34932 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSPA4P34932 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSPA4P34932 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HSPA4P34932 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms