Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCKBRP32239 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCKBRP32239 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms