Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD40LGP29965 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD40LGP29965 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms