Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP1P28562 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms