Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLD1P28340 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLD1P28340 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLD1P28340 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLD1P28340 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLD1P28340 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLD1P28340 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
POLD1P28340 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLD1P28340 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLD1P28340 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLD1P28340 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLD1P28340 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLD1P28340 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLD1P28340 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLD1P28340 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLD1P28340 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
POLD1P28340 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLD1P28340 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLD1P28340 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLD1P28340 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
POLD1P28340 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
POLD1P28340 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLD1P28340 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLD1P28340 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLD1P28340 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
POLD1P28340 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLD1P28340 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLD1P28340 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLD1P28340 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLD1P28340 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLD1P28340 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLD1P28340 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLD1P28340 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLD1P28340 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLD1P28340 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLD1P28340 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLD1P28340 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLD1P28340 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLD1P28340 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
POLD1P28340 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLD1P28340 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLD1P28340 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLD1P28340 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLD1P28340 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLD1P28340 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
POLD1P28340 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLD1P28340 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLD1P28340 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLD1P28340 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLD1P28340 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLD1P28340 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLD1P28340 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLD1P28340 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLD1P28340 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLD1P28340 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLD1P28340 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLD1P28340 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLD1P28340 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLD1P28340 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLD1P28340 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLD1P28340 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLD1P28340 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLD1P28340 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLD1P28340 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLD1P28340 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLD1P28340 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLD1P28340 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
POLD1P28340 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLD1P28340 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
POLD1P28340 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLD1P28340 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLD1P28340 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLD1P28340 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLD1P28340 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLD1P28340 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLD1P28340 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLD1P28340 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLD1P28340 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLD1P28340 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLD1P28340 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLD1P28340 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLD1P28340 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLD1P28340 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLD1P28340 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLD1P28340 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLD1P28340 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLD1P28340 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLD1P28340 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
POLD1P28340 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
POLD1P28340 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLD1P28340 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
POLD1P28340 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
POLD1P28340 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLD1P28340 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLD1P28340 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
POLD1P28340 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD1P28340 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD1P28340 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD1P28340 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLD1P28340 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms