Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMBRP28336 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMBRP28336 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMBRP28336 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NMBRP28336 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMBRP28336 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMBRP28336 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NMBRP28336 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NMBRP28336 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMBRP28336 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMBRP28336 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMBRP28336 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMBRP28336 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMBRP28336 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMBRP28336 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMBRP28336 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMBRP28336 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMBRP28336 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMBRP28336 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMBRP28336 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMBRP28336 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NMBRP28336 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NMBRP28336 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NMBRP28336 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NMBRP28336 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NMBRP28336 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NMBRP28336 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NMBRP28336 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NMBRP28336 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NMBRP28336 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NMBRP28336 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NMBRP28336 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NMBRP28336 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NMBRP28336 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NMBRP28336 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NMBRP28336 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NMBRP28336 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NMBRP28336 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NMBRP28336 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NMBRP28336 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NMBRP28336 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NMBRP28336 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NMBRP28336 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NMBRP28336 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NMBRP28336 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NMBRP28336 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NMBRP28336 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NMBRP28336 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NMBRP28336 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NMBRP28336 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NMBRP28336 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NMBRP28336 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NMBRP28336 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NMBRP28336 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NMBRP28336 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NMBRP28336 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NMBRP28336 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NMBRP28336 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NMBRP28336 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NMBRP28336 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NMBRP28336 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NMBRP28336 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NMBRP28336 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NMBRP28336 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NMBRP28336 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NMBRP28336 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NMBRP28336 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NMBRP28336 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NMBRP28336 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NMBRP28336 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NMBRP28336 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NMBRP28336 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NMBRP28336 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NMBRP28336 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NMBRP28336 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NMBRP28336 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NMBRP28336 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NMBRP28336 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NMBRP28336 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NMBRP28336 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NMBRP28336 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NMBRP28336 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NMBRP28336 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NMBRP28336 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NMBRP28336 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NMBRP28336 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NMBRP28336 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NMBRP28336 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NMBRP28336 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NMBRP28336 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NMBRP28336 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NMBRP28336 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NMBRP28336 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NMBRP28336 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NMBRP28336 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NMBRP28336 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NMBRP28336 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NMBRP28336 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NMBRP28336 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NMBRP28336 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms