Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM3P25205 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM3P25205 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM3P25205 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM3P25205 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM3P25205 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM3P25205 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCM3P25205 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCM3P25205 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCM3P25205 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MCM3P25205 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MCM3P25205 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCM3P25205 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MCM3P25205 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCM3P25205 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCM3P25205 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCM3P25205 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MCM3P25205 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCM3P25205 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MCM3P25205 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCM3P25205 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCM3P25205 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCM3P25205 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM3P25205 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM3P25205 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM3P25205 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM3P25205 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM3P25205 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM3P25205 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM3P25205 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM3P25205 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM3P25205 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM3P25205 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM3P25205 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM3P25205 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM3P25205 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM3P25205 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM3P25205 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM3P25205 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM3P25205 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCM3P25205 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM3P25205 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM3P25205 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM3P25205 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM3P25205 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM3P25205 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM3P25205 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM3P25205 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM3P25205 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM3P25205 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM3P25205 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM3P25205 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM3P25205 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM3P25205 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM3P25205 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM3P25205 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM3P25205 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM3P25205 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM3P25205 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM3P25205 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCM3P25205 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCM3P25205 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCM3P25205 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCM3P25205 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCM3P25205 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCM3P25205 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCM3P25205 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCM3P25205 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCM3P25205 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCM3P25205 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCM3P25205 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCM3P25205 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCM3P25205 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MCM3P25205 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCM3P25205 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCM3P25205 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCM3P25205 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCM3P25205 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCM3P25205 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MCM3P25205 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCM3P25205 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCM3P25205 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCM3P25205 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCM3P25205 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCM3P25205 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCM3P25205 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCM3P25205 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCM3P25205 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCM3P25205 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCM3P25205 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCM3P25205 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCM3P25205 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCM3P25205 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCM3P25205 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCM3P25205 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCM3P25205 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCM3P25205 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCM3P25205 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCM3P25205 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCM3P25205 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms