Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms