Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms