Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
ITGB4P16144 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms