Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNNT1P13805 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNT1P13805 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms