Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-DOBP13765 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HLA-DOBP13765 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms