Protein–RNA interactions for Protein: P11597

CETP, Cholesteryl ester transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CETPP11597 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CETPP11597 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CETPP11597 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CETPP11597 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CETPP11597 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CETPP11597 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CETPP11597 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CETPP11597 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CETPP11597 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CETPP11597 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CETPP11597 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CETPP11597 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CETPP11597 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CETPP11597 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CETPP11597 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CETPP11597 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CETPP11597 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CETPP11597 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CETPP11597 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CETPP11597 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CETPP11597 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CETPP11597 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CETPP11597 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CETPP11597 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CETPP11597 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CETPP11597 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CETPP11597 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CETPP11597 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CETPP11597 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CETPP11597 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CETPP11597 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CETPP11597 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CETPP11597 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CETPP11597 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CETPP11597 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CETPP11597 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CETPP11597 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CETPP11597 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CETPP11597 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CETPP11597 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CETPP11597 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CETPP11597 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CETPP11597 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CETPP11597 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CETPP11597 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CETPP11597 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CETPP11597 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CETPP11597 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CETPP11597 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CETPP11597 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CETPP11597 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CETPP11597 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CETPP11597 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CETPP11597 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CETPP11597 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CETPP11597 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CETPP11597 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CETPP11597 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CETPP11597 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CETPP11597 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CETPP11597 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CETPP11597 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CETPP11597 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CETPP11597 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CETPP11597 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CETPP11597 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CETPP11597 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CETPP11597 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CETPP11597 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CETPP11597 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CETPP11597 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CETPP11597 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CETPP11597 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CETPP11597 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CETPP11597 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CETPP11597 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CETPP11597 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CETPP11597 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CETPP11597 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CETPP11597 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CETPP11597 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CETPP11597 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CETPP11597 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CETPP11597 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CETPP11597 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CETPP11597 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CETPP11597 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CETPP11597 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CETPP11597 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CETPP11597 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CETPP11597 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CETPP11597 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CETPP11597 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CETPP11597 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CETPP11597 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CETPP11597 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CETPP11597 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CETPP11597 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CETPP11597 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CETPP11597 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms