Protein–RNA interactions for Protein: P0DML3

CSH2, Chorionic somatomammotropin hormone 2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSH2P0DML3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSH2P0DML3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSH2P0DML3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSH2P0DML3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSH2P0DML3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSH2P0DML3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSH2P0DML3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSH2P0DML3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSH2P0DML3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSH2P0DML3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSH2P0DML3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSH2P0DML3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSH2P0DML3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSH2P0DML3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSH2P0DML3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CSH2P0DML3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSH2P0DML3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms