Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAPPC2BP0DI82 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAPPC2BP0DI82 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms