Protein–RNA interactions for Protein: P0CX24

RPL20B, 60S ribosomal protein L20-B, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL20BP0CX24 SAK1YER129W 3429 nt2.13□□□□□ -2.07
RPL20BP0CX24 SCD5YOR329C 2619 nt2.13□□□□□ -2.07
RPL20BP0CX24 APL5YPL195W 2799 nt2.13□□□□□ -2.07
RPL20BP0CX24 RPS18BYML026C 441 nt2.13□□□□□ -2.07
RPL20BP0CX24 YSY6YBR162W-A 198 nt2.13□□□□□ -2.07
RPL20BP0CX24 IPT1YDR072C 1584 nt2.13□□□□□ -2.07
RPL20BP0CX24 YJR003CYJR003C 1560 nt2.13□□□□□ -2.07
RPL20BP0CX24 SVL3YPL032C 2478 nt2.13□□□□□ -2.07
RPL20BP0CX24 PHO2YDL106C 1680 nt2.12□□□□□ -2.07
RPL20BP0CX24 YER121WYER121W 345 nt2.12□□□□□ -2.07
RPL20BP0CX24 YGR050CYGR050C 357 nt2.12□□□□□ -2.07
RPL20BP0CX24 YPR146CYPR146C 330 nt2.12□□□□□ -2.07
RPL20BP0CX24 MPH1YIR002C 2982 nt2.12□□□□□ -2.07
RPL20BP0CX24 RRP12YPL012W 3687 nt2.12□□□□□ -2.07
RPL20BP0CX24 YPR089WYPR089W 2667 nt2.12□□□□□ -2.07
RPL20BP0CX24 PRP6YBR055C 2700 nt2.11□□□□□ -2.07
RPL20BP0CX24 MZM1YDR493W 372 nt2.11□□□□□ -2.07
RPL20BP0CX24 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.11□□□□□ -2.07
RPL20BP0CX24 LCL1YPL056C 306 nt2.11□□□□□ -2.07
RPL20BP0CX24 KSP1YHR082C 3090 nt2.11□□□□□ -2.07
RPL20BP0CX24 HRD3YLR207W 2502 nt2.11□□□□□ -2.07
RPL20BP0CX24 YNL018CYNL018C 1839 nt2.1□□□□□ -2.07
RPL20BP0CX24 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.1□□□□□ -2.07
RPL20BP0CX24 RPL27BYDR471W 411 nt2.1□□□□□ -2.07
RPL20BP0CX24 LSO2YGR169C-A 279 nt2.1□□□□□ -2.07
RPL20BP0CX24 YJL202CYJL202C 348 nt2.1□□□□□ -2.07
RPL20BP0CX24 YKL136WYKL136W 399 nt2.1□□□□□ -2.07
RPL20BP0CX24 REV1YOR346W 2958 nt2.1□□□□□ -2.07
RPL20BP0CX24 NAN1YPL126W 2691 nt2.1□□□□□ -2.07
RPL20BP0CX24 NUP120YKL057C 3114 nt2.09□□□□□ -2.07
RPL20BP0CX24 WIP1YDR374W-A 270 nt2.09□□□□□ -2.07
RPL20BP0CX24 ABM1YJR108W 372 nt2.09□□□□□ -2.07
RPL20BP0CX24 FCF2YLR051C 654 nt2.09□□□□□ -2.07
RPL20BP0CX24 GRX8YLR364W 330 nt2.09□□□□□ -2.07
RPL20BP0CX24 YNL010WYNL010W 726 nt2.09□□□□□ -2.07
RPL20BP0CX24 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt2.09□□□□□ -2.07
RPL20BP0CX24 MLH1YMR167W 2310 nt2.09□□□□□ -2.07
RPL20BP0CX24 UBP11YKR098C 2154 nt2.09□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 PSD2YGR170W 3417 nt2.08□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 NCL1YBL024W 2055 nt2.08□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 IRA2YOL081W 9240 nt2.08□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 SMC6YLR383W 3345 nt2.08□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 KAR3YPR141C 2190 nt2.08□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 INP51YIL002C 2841 nt2.08□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 MRP10YDL045W-A 288 nt2.08□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 YRB1YDR002W 606 nt2.08□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 VTC1YER072W 390 nt2.08□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 YFR056CYFR056C 369 nt2.08□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 MSL1YIR009W 336 nt2.08□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 UTP30YKR060W 825 nt2.08□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 YAR053WYAR053W 297 nt2.08□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 RPL9BYNL067W 576 nt2.08□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 YAF9YNL107W 681 nt2.08□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 YOR199WYOR199W 330 nt2.08□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 RTC6YPL183W-A 282 nt2.08□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 PRK1YIL095W 2433 nt2.08□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 NUP170YBL079W 4509 nt2.08□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 UBP15YMR304W 3693 nt2.07□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 SHE2YKL130C 741 nt2.07□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 RPL26AYLR344W 384 nt2.07□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt2.07□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 PTC5YOR090C 1719 nt2.07□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 HOS4YIL112W 3252 nt2.06□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 EDS1YBR033W 2760 nt2.06□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 BFA1YJR053W 1725 nt2.06□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 YDL011CYDL011C 324 nt2.06□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt2.06□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 YKL118WYKL118W 312 nt2.06□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 YPR097WYPR097W 3222 nt2.06□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 PCF11YDR228C 1881 nt2.05□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 VPS13YLL040C 9435 nt2.05□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 SPF1YEL031W 3648 nt2.05□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 YFH1YDL120W 525 nt2.05□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.05□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 ACB1YGR037C 264 nt2.05□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 ISF1YMR081C 1017 nt2.05□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt2.05□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 KTI11YBL071W-A 249 nt2.05□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 TIM18YOR297C 579 nt2.05□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 YBR277CYBR277C 402 nt2.05□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 SAP190YKR028W 3102 nt2.05□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 NUP100YKL068W 2880 nt2.04□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 YEF3YLR249W 3135 nt2.04□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 NHP2YDL208W 471 nt2.04□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 QCR7YDR529C 384 nt2.04□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 PEX4YGR133W 552 nt2.04□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 NOP10YHR072W-A 177 nt2.04□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 CLN3YAL040C 1743 nt2.04□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 BIL1YOR304C-A 231 nt2.04□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 VPS16YPL045W 2397 nt2.04□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 YPL182CYPL182C 384 nt2.04□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 VPS35YJL154C 2835 nt2.04□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 CDC50YCR094W 1176 nt2.03□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 RPS24AYER074W 408 nt2.03□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 SMD1YGR074W 441 nt2.03□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 TWF1YGR080W 999 nt2.03□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 YBL073WYBL073W 312 nt2.03□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 PGA1YNL158W 597 nt2.03□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 IRC23YOR044W 474 nt2.03□□□□□ -2.08
RPL20BP0CX24 HSC82YMR186W 2118 nt2.03□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.7 ms