Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC166P0CW27 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms