Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CT47B1P0C2W7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CT47B1P0C2W7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CT47B1P0C2W7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CT47B1P0C2W7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CT47B1P0C2W7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CT47B1P0C2W7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CT47B1P0C2W7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CT47B1P0C2W7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CT47B1P0C2W7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CT47B1P0C2W7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CT47B1P0C2W7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CT47B1P0C2W7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CT47B1P0C2W7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CT47B1P0C2W7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CT47B1P0C2W7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CT47B1P0C2W7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CT47B1P0C2W7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CT47B1P0C2W7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CT47B1P0C2W7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CT47B1P0C2W7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CT47B1P0C2W7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms