Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
POLA1P09884 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
POLA1P09884 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
POLA1P09884 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
POLA1P09884 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
POLA1P09884 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
POLA1P09884 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
POLA1P09884 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
POLA1P09884 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
POLA1P09884 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
POLA1P09884 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
POLA1P09884 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
POLA1P09884 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
POLA1P09884 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
POLA1P09884 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
POLA1P09884 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
POLA1P09884 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
POLA1P09884 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
POLA1P09884 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
POLA1P09884 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
POLA1P09884 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
POLA1P09884 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
POLA1P09884 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
POLA1P09884 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
POLA1P09884 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
POLA1P09884 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
POLA1P09884 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
POLA1P09884 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
POLA1P09884 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
POLA1P09884 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
POLA1P09884 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
POLA1P09884 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
POLA1P09884 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
POLA1P09884 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
POLA1P09884 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
POLA1P09884 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
POLA1P09884 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
POLA1P09884 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
POLA1P09884 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
POLA1P09884 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
POLA1P09884 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
POLA1P09884 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
POLA1P09884 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
POLA1P09884 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
POLA1P09884 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
POLA1P09884 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
POLA1P09884 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
POLA1P09884 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
POLA1P09884 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
POLA1P09884 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
POLA1P09884 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
POLA1P09884 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
POLA1P09884 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
POLA1P09884 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
POLA1P09884 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
POLA1P09884 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
POLA1P09884 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
POLA1P09884 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
POLA1P09884 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
POLA1P09884 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
POLA1P09884 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
POLA1P09884 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
POLA1P09884 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
POLA1P09884 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
POLA1P09884 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
POLA1P09884 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
POLA1P09884 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
POLA1P09884 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
POLA1P09884 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
POLA1P09884 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
POLA1P09884 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
POLA1P09884 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
POLA1P09884 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
POLA1P09884 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
POLA1P09884 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
POLA1P09884 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
POLA1P09884 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
POLA1P09884 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
POLA1P09884 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
POLA1P09884 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
POLA1P09884 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
POLA1P09884 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
POLA1P09884 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
POLA1P09884 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
POLA1P09884 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
POLA1P09884 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
POLA1P09884 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
POLA1P09884 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
POLA1P09884 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
POLA1P09884 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
POLA1P09884 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
POLA1P09884 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
POLA1P09884 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
POLA1P09884 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
POLA1P09884 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
POLA1P09884 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC34.09■■■■□ 3.05
POLA1P09884 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
POLA1P09884 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
POLA1P09884 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
POLA1P09884 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms