Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEFMP07197 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEFMP07197 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEFMP07197 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEFMP07197 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEFMP07197 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
NEFMP07197 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEFMP07197 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NEFMP07197 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEFMP07197 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NEFMP07197 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEFMP07197 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEFMP07197 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEFMP07197 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEFMP07197 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEFMP07197 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEFMP07197 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEFMP07197 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEFMP07197 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEFMP07197 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NEFMP07197 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEFMP07197 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEFMP07197 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NEFMP07197 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEFMP07197 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEFMP07197 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEFMP07197 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEFMP07197 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEFMP07197 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEFMP07197 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEFMP07197 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEFMP07197 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEFMP07197 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEFMP07197 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEFMP07197 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEFMP07197 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEFMP07197 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEFMP07197 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEFMP07197 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEFMP07197 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEFMP07197 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEFMP07197 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEFMP07197 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEFMP07197 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEFMP07197 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEFMP07197 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEFMP07197 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEFMP07197 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEFMP07197 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEFMP07197 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEFMP07197 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFMP07197 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFMP07197 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFMP07197 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFMP07197 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFMP07197 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFMP07197 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFMP07197 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFMP07197 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFMP07197 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFMP07197 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFMP07197 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFMP07197 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFMP07197 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFMP07197 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFMP07197 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFMP07197 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFMP07197 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFMP07197 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFMP07197 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFMP07197 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFMP07197 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFMP07197 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFMP07197 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFMP07197 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFMP07197 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFMP07197 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFMP07197 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFMP07197 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFMP07197 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEFMP07197 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEFMP07197 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEFMP07197 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEFMP07197 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEFMP07197 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEFMP07197 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEFMP07197 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEFMP07197 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEFMP07197 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEFMP07197 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEFMP07197 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEFMP07197 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEFMP07197 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEFMP07197 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEFMP07197 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEFMP07197 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NEFMP07197 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEFMP07197 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEFMP07197 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEFMP07197 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms