Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC24BO95487 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms