Protein–RNA interactions for Protein: O95425

SVIL, Supervillin, humanhuman

Predictions only

Length 2,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVILO95425 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVILO95425 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVILO95425 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVILO95425 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVILO95425 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVILO95425 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVILO95425 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVILO95425 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVILO95425 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVILO95425 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVILO95425 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SVILO95425 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SVILO95425 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SVILO95425 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SVILO95425 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SVILO95425 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SVILO95425 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SVILO95425 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SVILO95425 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SVILO95425 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SVILO95425 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SVILO95425 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SVILO95425 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SVILO95425 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SVILO95425 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SVILO95425 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SVILO95425 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SVILO95425 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SVILO95425 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SVILO95425 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SVILO95425 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SVILO95425 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SVILO95425 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SVILO95425 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SVILO95425 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SVILO95425 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SVILO95425 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SVILO95425 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVILO95425 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVILO95425 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVILO95425 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVILO95425 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVILO95425 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SVILO95425 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVILO95425 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SVILO95425 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVILO95425 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVILO95425 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVILO95425 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVILO95425 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVILO95425 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVILO95425 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVILO95425 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVILO95425 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVILO95425 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVILO95425 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVILO95425 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SVILO95425 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVILO95425 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVILO95425 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVILO95425 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVILO95425 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVILO95425 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVILO95425 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVILO95425 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVILO95425 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVILO95425 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVILO95425 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVILO95425 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVILO95425 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVILO95425 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SVILO95425 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVILO95425 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVILO95425 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVILO95425 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVILO95425 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVILO95425 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVILO95425 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVILO95425 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVILO95425 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVILO95425 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SVILO95425 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVILO95425 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVILO95425 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVILO95425 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVILO95425 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVILO95425 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SVILO95425 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVILO95425 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVILO95425 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVILO95425 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVILO95425 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVILO95425 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVILO95425 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVILO95425 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVILO95425 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVILO95425 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVILO95425 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVILO95425 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SVILO95425 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms