Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
IGSF3O75054 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGSF3O75054 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms