Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NOBOXO60393 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms