Protein–RNA interactions for Protein: O60318

MCM3AP, Germinal-center associated nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3APO60318 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCM3APO60318 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCM3APO60318 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCM3APO60318 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCM3APO60318 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MCM3APO60318 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCM3APO60318 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCM3APO60318 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCM3APO60318 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCM3APO60318 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCM3APO60318 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCM3APO60318 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCM3APO60318 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCM3APO60318 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCM3APO60318 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCM3APO60318 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MCM3APO60318 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCM3APO60318 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MCM3APO60318 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCM3APO60318 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCM3APO60318 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCM3APO60318 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCM3APO60318 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms