Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTIFO43310 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTIFO43310 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTIFO43310 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTIFO43310 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTIFO43310 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTIFO43310 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTIFO43310 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTIFO43310 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CTIFO43310 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTIFO43310 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTIFO43310 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTIFO43310 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTIFO43310 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTIFO43310 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTIFO43310 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTIFO43310 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTIFO43310 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTIFO43310 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTIFO43310 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTIFO43310 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTIFO43310 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTIFO43310 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTIFO43310 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTIFO43310 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTIFO43310 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTIFO43310 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTIFO43310 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTIFO43310 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTIFO43310 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTIFO43310 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTIFO43310 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTIFO43310 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTIFO43310 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTIFO43310 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTIFO43310 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTIFO43310 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CTIFO43310 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTIFO43310 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTIFO43310 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTIFO43310 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTIFO43310 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTIFO43310 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTIFO43310 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTIFO43310 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTIFO43310 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTIFO43310 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTIFO43310 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTIFO43310 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTIFO43310 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTIFO43310 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTIFO43310 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTIFO43310 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTIFO43310 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTIFO43310 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTIFO43310 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTIFO43310 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTIFO43310 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTIFO43310 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTIFO43310 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTIFO43310 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTIFO43310 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTIFO43310 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTIFO43310 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTIFO43310 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTIFO43310 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTIFO43310 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTIFO43310 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTIFO43310 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTIFO43310 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTIFO43310 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTIFO43310 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CTIFO43310 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTIFO43310 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CTIFO43310 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTIFO43310 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTIFO43310 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTIFO43310 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTIFO43310 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTIFO43310 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTIFO43310 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTIFO43310 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTIFO43310 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTIFO43310 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTIFO43310 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTIFO43310 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTIFO43310 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTIFO43310 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTIFO43310 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTIFO43310 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTIFO43310 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTIFO43310 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTIFO43310 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTIFO43310 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTIFO43310 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTIFO43310 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTIFO43310 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTIFO43310 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTIFO43310 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTIFO43310 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms