Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SRGAP3O43295 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms