Protein–RNA interactions for Protein: O15060

ZBTB39, Zinc finger and BTB domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB39O15060 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBTB39O15060 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms