Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARVCFO00192 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARVCFO00192 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms