Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QKU1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QKU1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QKU1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QKU1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QKU1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
J3QKU1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
J3QKU1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
J3QKU1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
J3QKU1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
J3QKU1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
J3QKU1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
J3QKU1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QKU1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QKU1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QKU1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QKU1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QKU1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QKU1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QKU1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QKU1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QKU1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QKU1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QKU1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QKU1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QKU1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QKU1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QKU1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QKU1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QKU1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QKU1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
J3QKU1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18■□□□□ 0.47
J3QKU1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18■□□□□ 0.47
J3QKU1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18■□□□□ 0.47
J3QKU1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
J3QKU1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
J3QKU1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18■□□□□ 0.47
J3QKU1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
J3QKU1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
J3QKU1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
J3QKU1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
J3QKU1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
J3QKU1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
J3QKU1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QKU1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18■□□□□ 0.47
J3QKU1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
J3QKU1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QKU1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QKU1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QKU1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
J3QKU1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QKU1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QKU1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QKU1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QKU1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QKU1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QKU1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QKU1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QKU1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QKU1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QKU1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QKU1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QKU1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QKU1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QKU1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QKU1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QKU1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QKU1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QKU1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QKU1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QKU1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QKU1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QKU1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QKU1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QKU1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QKU1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QKU1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QKU1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QKU1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QKU1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QKU1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QKU1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QKU1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QKU1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QKU1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QKU1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QKU1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QKU1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QKU1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QKU1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QKU1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QKU1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QKU1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QKU1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QKU1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QKU1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QKU1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QKU1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QKU1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QKU1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.4 ms