Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVV-1B6SEH8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ERVV-1B6SEH8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms