Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP27XA6NNY8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP27XA6NNY8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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