Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MEIS3P1A6NDR6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms