Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 C2orf91-201ENST00000378711 3721 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 LINC02357-201ENST00000637313 1622 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 CCNB2-205ENST00000621385 2503 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 SEC23IP-201ENST00000369075 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 MEF2C-217ENST00000510942 3446 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 AL109918.1-201ENST00000602367 3039 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 LTBP1-202ENST00000404525 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 NKRF-201ENST00000304449 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 AC019117.2-202ENST00000635900 1476 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 AL136985.3-201ENST00000637377 2219 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 BCL6-201ENST00000232014 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 AC016582.1-202ENST00000636341 2982 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 SRL-201ENST00000399609 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 AC008817.1-201ENST00000504215 1562 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 LMLN-202ENST00000332636 1812 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 MARF1-201ENST00000396368 7743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 AC011447.6-201ENST00000623510 2598 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 TBCCD1-201ENST00000338733 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 GULP1-203ENST00000409609 1932 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 RSRC1-202ENST00000312179 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 ABI1-206ENST00000376140 1446 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 USP46-207ENST00000508499 1419 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 MACROD2-202ENST00000378058 4025 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 DICER1-214ENST00000556045 2776 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 ZNF701-201ENST00000301093 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 CHI3L2-204ENST00000466741 1518 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 RNASE3-201ENST00000304639 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 TTTY8B-201ENST00000328819 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 TTTY8-201ENST00000329684 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 SSX2-202ENST00000337502 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 IGLV1-51-201ENST00000390290 389 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 HP-204ENST00000398131 1252 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 MRO-202ENST00000398439 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 LIPK-201ENST00000404190 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 LINC01238-201ENST00000416204 590 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 RPL7L1P12-201ENST00000417594 729 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 TYROBP-202ENST00000424586 541 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 AC099066.1-201ENST00000428148 534 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 AF241728.1-201ENST00000432359 1180 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 CRIP1P4-201ENST00000442565 229 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 ZNF90P3-201ENST00000450345 1192 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 PGA5-202ENST00000451616 971 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 LINC00544-202ENST00000481738 575 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 EXOSC1-210ENST00000485122 564 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 RPS3P7-201ENST00000488662 726 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 LINC01095-203ENST00000512063 1175 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 KRT73-AS1-203ENST00000552364 3808 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 WDR61-202ENST00000558311 1266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 DRAIC-204ENST00000558781 1222 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 LINC02134-201ENST00000562980 557 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 AL121830.1-203ENST00000598694 701 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 AL022345.3-201ENST00000611406 228 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 AC025031.3-201ENST00000611566 368 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 Metazoa_SRP.74-201ENST00000614973 284 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 ZNF410-225ENST00000639051 936 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 AL023806.3-201ENST00000638502 2704 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 IMPG1-204ENST00000611179 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 PCLO-209ENST00000618073 1614 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 SLC31A1-201ENST00000374212 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 RUNX1T1-249ENST00000613886 7401 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 UBE4B-202ENST00000343090 5267 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 ZNF396-201ENST00000306346 2788 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 AC009061.2-203ENST00000635000 1462 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 PABPC5-201ENST00000312600 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 SLC17A2-202ENST00000360488 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 CPEB4-209ENST00000522336 1551 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 LINC02367-201ENST00000567749 4388 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 SOX9-AS1-217ENST00000623935 1563 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 LINC01180-201ENST00000589259 2025 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 USP17L26-202ENST00000610514 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 USP17L20-202ENST00000613757 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 USP17L11-202ENST00000613973 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 USP17L17-202ENST00000614762 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 USP17L19-202ENST00000615989 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 USP17L13-202ENST00000616303 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 USP17L18-202ENST00000619296 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 USP17L25-202ENST00000621472 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 USP17L22-202ENST00000622009 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 USP17L24-202ENST00000622713 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 TNMD-201ENST00000373031 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 SLMAP-219ENST00000494088 1305 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 FBXO40-201ENST00000338040 5929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 FOXJ3-205ENST00000372573 5309 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 CPB1-208ENST00000491148 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 CD44-208ENST00000428726 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 CDC27-201ENST00000066544 5801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 AL390036.1-202ENST00000634635 2439 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 CD46-208ENST00000367042 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 CRB1-202ENST00000367399 3885 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 CHN2-208ENST00000412711 2991 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 PLA2G7-202ENST00000537365 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 CFAP61-207ENST00000389656 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 TRAV8-6-201ENST00000390443 561 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 RMDN2-AS1-201ENST00000414365 859 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 ARHGEF7-IT1-201ENST00000423329 804 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTGFRP43088 LINC00358-201ENST00000432697 1276 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms