Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NRXN3Q9Y4C0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms