Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PHF8Q9UPP1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHF8Q9UPP1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms